Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tube1Q9D6T1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tube1Q9D6T1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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