Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms