Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms