Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms