Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pabpc6Q9D4E6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pabpc6Q9D4E6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pabpc6Q9D4E6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pabpc6Q9D4E6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pabpc6Q9D4E6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pabpc6Q9D4E6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pabpc6Q9D4E6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pabpc6Q9D4E6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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