Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cfap53Q9D439 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cfap53Q9D439 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cfap53Q9D439 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cfap53Q9D439 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cfap53Q9D439 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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