Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms