Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim42Q9D2H5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim42Q9D2H5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim42Q9D2H5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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