Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pramef12Q9D2F1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef12Q9D2F1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms