Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Mrpl53Q9D1H8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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