Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx7Q9CY18 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms