Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cnot11Q9CWN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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