Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms