Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9CRC3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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