Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim8Q9CQQ0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms