Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms