Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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