Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tmed6Q9CQG0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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