Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rab5aQ9CQD1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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