Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Chchd1Q9CQA6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Chchd1Q9CQA6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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