Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg3Q9CPX6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms