Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms