Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac9Q99N13 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Hdac9Q99N13 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms