Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PtprtQ99M80 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PtprtQ99M80 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PtprtQ99M80 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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