Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms