Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms