Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms