Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LsrQ99KG5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms