Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrbp1Q99J45 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrbp1Q99J45 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms