Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc30a1Q99J38 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc30a1Q99J38 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc30a1Q99J38 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms