Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms