Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms