Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx15Q91WE1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx15Q91WE1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx15Q91WE1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms