Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dnajc28Q8VCE1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnajc28Q8VCE1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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