Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms