Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms