Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmpQ8R373 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms