Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms