Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Hoxc12Q8K5B8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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