Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms