Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OptnQ8K3K8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms