Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms