Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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