Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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