Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms