Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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