Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrnp27Q8K194 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms