Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c1Q8K193 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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