Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trip10Q8CJ53 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms