Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vps37aQ8CHS8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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